Det ska vara liten bokstav, omega – vilket står för den tjugofjärde och sista bokstaven i det grekiska alfabetet. Bindestreck används alltid i fackspråkliga sammanhang: trean hänvisar till dubbelbindningen mellan kolatomerna nummer 3 och 4, och i kemin skrivs molekylformler med bindestreck. Varianten med bindestreck är också den som används i källor som Nationalencyklopedin och Rikstermbanken.

Från allmänspråklig synpunkt fyller bindestrecket knappast någon funktion, men tvekar man är det enklast att följa den fackspråkliga konventionen: omega-3, omega-3-fettsyror.